过程是在明万历二十一年公元1593年8月13日，有李氏朝鲜王国平民汇报，宣称看到倭舰出现在尚庆右道巨济岛附近集结。
故此李氏朝鲜军营方面，在得到消息后的第二日清晨，李氏朝鲜全罗左道水军节度使：李舜臣，就派出了6艘板屋船去引诱倭舰。
而幕府水师第三军中务少辅：胁坂安治，的海军在见到板屋船后，马上就追踪上来，一直追到闲山岛附近的广阔海域，与李氏朝鲜全罗左道的水师相遇。
在李氏朝鲜全罗左道水军节度使与倭军的前两次交锋中，李氏朝鲜全罗左道水军节度使均采用的是，线型或圆型的连续式的进攻阵型。
虽然这种战术对于击溃敌方舰队很有效，但是也会让很大一部份的敌舰得以逃脱，使得无法有效消灭敌方军力。
为了克服这个缺点，李氏朝鲜全罗左道水军节度使在此次海战中，摆出了新型的鹤翼阵或称U型阵，意在不但要击溃倭军舰队，还要将之包围进而歼灭。
倭军的战术则是先派出快速的军舰突击，然后迅速派出主力战舰靠近并等后续船队，倭军的这种战术正中了李氏朝鲜全罗左道水军节度使的圈套。
也让李氏朝鲜水师以鹤翼阵将接近的倭军舰队包围住，舰上炮火从各个角度将被围的倭军舰队摧毁。
战斗也从早上一直打到傍晚。
其中幕府水师第三军中务少辅的三位主要领兵指挥官，幕府胁坂左兵卫、幕府渡边七卫门，两人阵亡，幕府真锅左马允在船上无奈切腹自尽。
又在丧失了59艘战舰后，幕府水师第三节中务少辅才开始了撤退，李氏朝鲜水师获得了大捷。
事后李氏朝鲜全罗左道水军节度使，在「见乃梁破倭状」中，宣称击毁的倭军舰队为；大船36艘、中船24艘、小船13艘、击破船数31艘。
9月13日，大明建州左卫军民指挥使：爱新觉罗·努尔哈赤（佟努尔哈赤），趁着大明帝国调兵抵抗入侵李氏朝鲜王国之际，就打着大明建州左卫官职的口号，来稳定女真各部，再加上他已经改姓（佟）用假名字。
就算光明正大的派出军队去攻打女真各部也不会被朝廷所怀疑，哪怕是女真内部仇人，也很难猜到，是谁灭了他们的部落？
故此明建州左卫军民指挥使就利用这个假名字，率兵前去东征攻打长白山女真各部，打算彻底统一起来。
这让海西女真叶赫部东城贝勒：纳拉·纳林布禄、叶赫西城贝勒：纳拉·布寨，特别不满意！毕竟之前两家有过联姻，而且如今建州左卫的势力不断扩大，作为姻亲却没有得到半点好处！
故此他俩就飞鸽传书，联系了哈达女真部贝勒：纳拉·猛骨孛罗、乌拉女真部贝勒：纳拉·满泰之弟：纳拉·布占泰、辉发女真部贝勒：纳拉·拜音达里。
同时又联合了长白山女真两部的朱舍里部女真、讷殷部女真，在加上漠南蒙古科尔沁部、锡伯部、卦尔察部，三支部落一共组成了「九部联军」，以叶赫女真部为主指挥共有3万人，分兵三路旌旗若现，浩浩荡荡的直扑建州女真军民左卫佛阿拉城而来，准备向建州女真左卫军民指挥使司发动进攻。
九部联军浩浩荡荡袭来之事，很快就被建州女真左卫的侦查兵们发现，他们第一时间就跑去，向坐镇在原大明奴儿干都指挥使司阿速江卫地区禀报情况。
得知后方老巢即将被围，他迅速做出反应撤回本部兵马全力南下，绕过讹答剌卫走潭州站、费儿忽站，途径虎儿文卫回到建州左卫军民指挥使司，在派出前锋铁骑去侦查。
回来才得知情况，发现敌军兵力从四方八方行军而来，这让明建州左卫军民指挥使开始害怕了起来，长期的对外征战自己也损失了不少士兵，虽然扩大了地盘，但自身也受到了伤害，再加上敌军人多势众，自己根本就不是他们的对手！
而且一联想到后果那就是，自己还曾与姻亲叶赫女真部有过节，要是战败免不了被杀，整个建州左卫军民指挥使司将被屠戮，如今他们联合军队，那么自己也可以向朝廷借兵求助。
于是他连忙写信一封，让士兵快马加鞭带出城去，打算交给明抚顺守御千户所游击将军：李永芳，因为之前入朝进献贡品时与此人有过接触关系不错。
因此想让他去通知明辽东巡抚兼都察院右副都御史：尤继，求救毕竟自己也算是朝廷的从三品武将，辽东都指挥使司方面的官员不可能见死不救！而且自己还为边疆立了战功。
虽然这份战功只是为自己扩大势力，但也确实为了大明守土安民。
9月16日明辽东巡抚在收到书信后，因顾及建州左卫军民指挥使司乃是大明帝国的管辖卫所，便任命抚顺守御千户所派出1千明军前去调解情况，让他们快速前往佛阿拉城去帮助建州女真左卫军队。
次日这边收到回信之后，总算让明建州左卫军民指挥使安心下来，不过他也不敢大意！还是召集大家商讨防御措施，最后明建州左卫军民指挥使决定采取了「避其侧翼攻其主力」的政策出战，也就是所谓的〈擒贼先擒王〉策略。
在布置好伏兵，根据地形布置了滚木礌石等防御工事计划后，又收到信息九部联军直接出兵将建州左卫军民指挥使司，所辖的军户守御千户所、军民守御百户所（村寨）营地都给捣毁，财物被劫掠，佛阿拉城即将不保！
故此明建州左卫军民指挥使为了稳住九部联军，拖延时间等待明军到来，便故意装作若无其事的样子，派人传话告诉他们，这天夜太晚了，不如明日再战，不愿意趁他们远道疲惫之际偷袭，而是明日光明正大的出战，实际上也是缓兵之计。
不管怎么说明建州左卫军民指挥使，终于可以睡一个安稳觉了，入睡前其妻继福晋：富察·衮代，以为他因恐惧而乱了方寸？竟然还能安然入睡？
所以便将其推醒，谁知明建州左卫军民指挥使却表示道“女真语：人如果有所害怕，虽然入寝，但也不能安眠！本座如果害怕，又如何能睡得好呢？之前听闻叶赫兵分三路来侵，因为不知何时到来，时时以为念，现在既然来了，那我也就安心了。”
次日由叶赫女真部两位贝勒率领的九部联军，已经迅速突破了建州女真左卫各个关卡，分别从西、北、东，三个方向开始包围了建州女真三卫，目前建州女真三卫的士兵和将领，均被迫退入古勒寨进行防守。
也就是说伏兵计划已经失败，第一道防线被摧毁了。
这边的明建州左卫军民指挥使很是紧张，他先派出了明建州左卫军民副千户：瓜尔佳·武理堪，前去侦查情况，顺便看看大明军队进展如何？
接受任务后明建州左卫军民副千户开始出发，但奇怪的是他向东侦查奔驰了百余里地，居然都不见有敌人踪影？这让他感觉有些奇怪，便要登上一座山岭观望，忽然望见前方乌鸦群集鸣噪，好像在阻挡自己去路。
富有战争经验的明建州左卫军民副千户立刻警觉起来，既而领悟到，兵马行动，鸟兽必惊之举，附近如果有大规模的行军活动，生物界决不会如此静谧。
他断定联军肯定不会从东部杀来，侦察方向不对，于是急归复命。
对于这点明建州左卫军民指挥使完全赞同他的见解与当机立断的行动，随即派他再行侦查，这次是向北路进发，自扎喀关向原先建州右卫军民指挥使司浑河女真部侦察。
傍晚时分卯时六刻，他来到浑河岸边，忽听见人马哨杂，遥望北岸火光密布如群星闪烁般，又看到四周旌旗遍布，才得知原来联军们正暂驻征鞍（栓马绳）准备扎营举火做饭。
见此情形明建州左卫军民副千户进行周密侦察，并伺机擒获了一名叶赫女真部巡逻兵，在对他严刑逼供之后了解到，九部联军一共出兵三万多，晚饭过后就将连夜越过沙济岭直捣建州左卫军民指挥所（古勒寨）军情紧急不容稍待。
于是明建州左卫军民副千户就挟持着俘虏，策马飞驰回来汇报，在返回古勒寨时，还遇到了从抚顺守御千户所赶来的大明军队，简直就是天兵下凡一般…。
此刻正值子时，由于明建州左卫军民指挥使得到情报，已经掌握了全部的军情，他才从容决定，全军安寝无须担心，待天亮后便出师迎击，以逸待劳。
到了9月20日卯时初，当建州三卫的士兵们听说联军竞有三万之众时，多半都吓得大惊失色！
但是明建州左卫军民副千户却很有把握地宣传道“女真语：敌虽众，可其心不一，非我辈敌也，我国人勇胆裂，一心一力，战则必胜，马匹器械，得必无算，败此辈之后，再无我兵敌也。”
这种合乎情理的分析，才使众人增强了一点信心，在誓师完毕之后，明建州左卫军民指挥使决定把精兵部署在古勒寨山上，伺机而战，毕竟明军此次可是出动了一千人马协同作战，必定会让九部联军有所忌惮，到时候在出击打他们个措手不及。
首先出战的叶赫九部联军先后围攻了扎喀城、黑济格城，两处均不克！反而还被建州女真三卫军队在沿途设置的重重障碍工事所阻拦，首尾如同数段长蛇一样散乱在古勒山下。
随后建州女真三卫军队开始小试牛刀，从山下以及两侧包抄过来，首挫九部联军的前锋军队，使得九部联军的大队士兵们迟疑不前，但建州女真三卫军队也不敢向前。
这让九部联军的头目叶赫女真西城贝勒，亲自带队冲锋，叶赫女真东城贝勒紧随其后一起反击，大规模的军队向山上袭来，箭镞如雨点般落下，形势对于兵力较少的建州女真三卫来说很是不力。